Submission Details
Molecule(s):
CC(C)Nc1cc(-c2c[nH]c(C(=O)N[C@H](CO)c3cccc(Cl)c3)c2)c(Cl)cn1
C[C@H]1COc2c(C3(N)CC3)c(F)cc3c(=O)c(C(=O)O)cn1c23
C=C1[C@@H](CO)[C@@H](O)C[C@@H]1n1cnc2c(=O)nc(N)[nH]c21
O=C1c2c(O)cc(O)cc2O[C@@H](c2ccc(O)c(O)c2)[C@@H]1O
O=C1C[C@H](c2ccc(O)c(O)c2)Oc2cc(O)cc(O)c21
Oc1cc(O)c2c(c1)O[C@H](c1ccc(O)c(O)c1)[C@H](O)C2
NCCNc1ccc(NCCN)c2c1C(=O)c1ccncc1C2=O
CC[C@]1(O)C(=O)OCc2c1cc1n(c2=O)Cc2cc3c(CN(C)C)c(O)ccc3nc2-1
Cc1cc2ncc(C(=O)NCC(C)(C)NCC(=O)N3CCC[C@@H]3C#N)cn2n1
OCC1=C[C@@H](O)[C@H]2C=CO[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O)[C@@H]12
O=c1[nH]cnc2c1ncn2[C@H]1O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@H]1O
MAR-TRE-fffca54f-12
Duplicate of:
MAN-UNK-10ff5583-1
Cc1cc(O)c2c(c1)C(=O)c1cc(O)cc(O)c1C2=O
Cc1ccc(NS(=O)(=O)c2cccc(C#N)c2)c2[nH]cc(C#N)c12
O=C(C[C@H]1NCCC[C@H]1O)Cn1cnc2cc(Br)c(Cl)cc2c1=O
Nc1nc(Cl)nc2c1ncn2[C@@H]1O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1F
NS(=O)(=O)c1cc([C@]2(O)NC(=O)c3ccccc32)ccc1Cl
CN(C)CCN1C(=O)c2cccc3cc(N)cc(c23)C1=O
Nc1cccc2c1C(=O)N([C@H]1CCC(=O)NC1=O)C2=O
Cc1c(O)c(C)c2c(c1O)C(=O)C[C@H](c1ccc(O)cc1)O2
COc1ccc(CC(C)(C)NC[C@@H](O)c2cc(O)cc3c2OCC(=O)N3)cc1
COc1cc2c(c(OC)c1OC)-c1ccc(OC)c(=O)cc1[C@@H](NC(C)=O)CC2
NC(=O)c1ncn([C@H]2O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@H]2O)c1O
Nc1nc(Cl)nc2c1ncn2[C@@H]1C[C@@H](O)[C@H](CO)O1
Nc1ncn([C@H]2O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1
O=c1[nH]c(=O)n([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO)O2)cc1I
Nc1nc(NC2CC2)c2ncn([C@H]3C=C[C@H](CO)C3)c2n1
Cc1cn([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO)O2)c(=O)[nH]c1=O
O=C1CC[C@H](N2C(=O)c3ccccc3C2=O)C(=O)N1
C[C@@]12CCC(=O)C=C1CC[C@H]1[C@@H]3CC[C@@](O)(C(=O)CO)[C@]3(C)C[C@H](O)[C@H]12
COc1cc2c(cc1Cc1cccc(Cl)c1F)c(=O)c(C(=O)O)cn2[C@H](CO)C(C)C
COc1cc(C[C@H]2C(=O)OC[C@@H]2Cc2ccc(OC)c(OC)c2)ccc1O
CC(C)(C#N)c1cc(Cn2cncn2)cc(C(C)(C)C#N)c1
Cn1c(=O)c2c(ncn2CC2OCCO2)n(C)c1=O
CN1C(=N)N[C@](C)(c2cc(NC(=O)c3ccc(F)cn3)ccc2F)CS1(=O)=O
Oc1cc2c(cc1O)[C@@H]1c3ccc(O)c(O)c3OC[C@@]1(O)C2
Nc1ccn([C@H]2O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1
C[C@@H]1O[C@H](n2cc(F)c(=O)[nH]c2=O)[C@H](O)[C@H]1O
CN1[C@@H](CCl)Nc2cc(Cl)c(S(N)(=O)=O)cc2S1(=O)=O
C=C1[C@H](CO)[C@H](O)C[C@H]1n1cnc2c(=O)nc(N)[nH]c21
C[C@@H](CN1CC(=O)NC(=O)C1)N1CC(=O)NC(=O)C1
Nc1nc2c(ncn2[C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO)O2)c(=O)[nH]1
CNS(=O)(=O)CC1CCC(N(C)c2ncnc3[nH]ccc23)CC1
CC(C)(C)NC[C@@H](O)COc1nsnc1N1CCOCC1
NC(=O)c1ncn([C@H]2O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@H]2O)n1
O=C(O)CNC(=O)C1C(=O)N(C2CCCCC2)C(=O)N(C2CCCCC2)C1=O
Nc1ncnc2c1ncn2[C@H]1C[C@@H](O)[C@@H](CO)O1
OC[C@H]1O[C@@H](OCCc2ccc(O)cc2)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O
O=c1[nH]cnc2c1ncn2[C@@H]1CC[C@H](CO)O1
Cn1c(=O)c2c(ncn2C[C@H](O)CO)n(C)c1=O
CC(=O)c1c(O)c(C)c(O)c2c1OC1=CC(=O)[C@H](C(C)=O)C(=O)[C@]12C
O=c1ccn([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO)O2)c(=O)[nH]1
O=c1[nH]c(=O)n([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO)O2)cc1F
O=c1ccn([C@H]2O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1
OCCN1C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1CO
O=c1cc(-c2ccc(O)c(O)c2)oc2cc(O)cc(O)c12
O=c1cc(-c2ccc(O)cc2)oc2cc(O)cc(O)c12
Cc1cn([C@@H]2O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@@H]2F)c(=O)[nH]c1=O
Nc1ncn([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO)O2)c(=O)n1
O=C(O)CCCN1CCC(O[C@@H](c2ccc(Cl)cc2)c2ccccn2)CC1
O=c1[nH]c(=O)n([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO)O2)cc1/C=C/Br
N[C@@H](C(=O)O)[C@@H](O)c1ccc(O)c(O)c1
C[C@H](O)Cn1cnc2c1c(=O)n(C)c(=O)n2C
CC(C)(C)NC[C@H](O)c1cc(O)cc(O)c1
MAR-TRE-fffca54f-64
Duplicate of:
KTA-UNK-ec872bc6-6
O=c1c(-c2ccc(O)cc2)coc2cc(O)cc(O)c12
CC(=O)Nc1cccc2c1c(Sc1ccc(Cl)cc1)c(C)n2CC(=O)O
OC[C@H]1O[C@H](c2ccc(F)c(Cc3cc4ccccc4s3)c2)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O
MAR-TRE-fffca54f-67
Duplicate of:
JOH-MSK-ec639444-4
CCC(=O)NC[C@@H]1C[C@H]1c1cccc2c1CCO2
Nc1nc(=O)n([C@H]2CS[C@H](CO)O2)cc1F
CN[C@@H]1[C@H]2O[C@@]3(O)C(=O)C[C@H](C)O[C@H]3O[C@H]2[C@@H](O)[C@H](NC)[C@H]1O
CCC[C@@H]1C[C@@H](C(=O)N[C@H]([C@H](C)O)[C@H]2O[C@H](SC)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)N(C)C1
O=C(O)[C@H](O)Cc1ccc(O)c(O)c1
CC1(C)O[C@H]2CO[C@@]3(COS(N)(=O)=O)OC(C)(C)O[C@@H]3[C@H]2O1
Nc1cccc2c1CN([C@@H]1CCC(=O)NC1=O)C2=O
Oc1ccc([C@@H]2CNCCc3c2cc(O)c(O)c3Cl)cc1
CN1[C@H]2CC[C@H]1CC(OC(=O)[C@@H](CO)c1ccccc1)C2
OCC(CO)N[C@H]1C[C@@](O)(CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O
Cc1c(Cc2ccc3ccccc3n2)c2cc(F)ccc2n1CC(=O)O
OC[C@@H]1O[C@@H](O[C@]2(CCl)O[C@H](CCl)[C@H](O)[C@H]2O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1Cl
C[C@@H](Cc1ccc(O)c(O)c1)[C@H](C)Cc1ccc(O)c(O)c1
CC(C)(C)NC[C@@H](O)c1ccc(O)c(CO)c1
O=C1OC(c2ccc(O)cc2)(c2ccc(O)cc2)c2ccccc21
COCCCN1CCC(NC(=O)c2cc(Cl)c(N)c3c2OCC3)CC1
Cn1c(=O)c2c(ncn2CCO)n(C)c1=O
Nc1ccn([C@H]2CS[C@H](CO)O2)c(=O)n1
O=C(O)CC(O)(CC(=O)O)C(=O)O
CC(C)(C)NC[C@H](O)c1ccc(O)c(CO)c1
MAR-TRE-fffca54f-87
Duplicate of:
KEI-TRE-fa9ada3e-13
Nc1nc(=O)c2ncn(CCC(CO)CO)c2[nH]1
CCN[C@@H]1C[C@H](C)S(=O)(=O)c2sc(S(N)(=O)=O)cc21
C=C[C@H]1CN2CC[C@@H]1C[C@H]2[C@H](O)c1ccnc2ccc(OC)cc12
CN1[C@@H]2C[C@H](OC(=O)[C@H](CO)c3ccccc3)C[C@@H]1[C@H](O)C2
NS(=O)(=O)c1cc2c(cc1Cl)N=CNS2(=O)=O
O=c1[nH]c2ccccc2n1CCCN1CCC(n2c(=O)[nH]c3cc(Cl)ccc32)CC1
O=C1OC2(c3ccc(O)cc3Oc3cc(O)ccc32)c2ccccc21
NC(=O)CN1C[C@H](O)CC1=O
CN(C)CCc1c[nH]c2ccc(C[C@@H]3COC(=O)N3)cc12
MAR-TRE-fffca54f-96
Duplicate of:
MAR-TRE-e86a56b5-63
CC(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O
NS(=O)(=O)c1cc(Cl)c(Cl)c(S(N)(=O)=O)c1
CC(=O)Nc1nnc(S(N)(=O)=O)s1
C[C@@H](c1ncncc1F)[C@](O)(Cn1cncn1)c1ccc(F)cc1F
COc1ccc([C@@H]2Sc3ccccc3N(CCN(C)C)C(=O)[C@@H]2OC(C)=O)cc1
Design Rationale:
This batch is the top 100 hits selected from the ChemSelleck library L3800 of FDA approved and passed phase 1 clinical trials molecules which were docked using our THINK software (http://treweren.com) into 1093 (5RF3) using a 3 centre pharmacophore requiring interactions with residues observed to be strongly interacting with fragments in the non-covalent crystal structures: (41),(44),(140),(142),(143),(144),(163),(166),(189). They were scored using an enhanced ChemScore function which doesn't require explicit hydrogens or tautomers.
Other Notes:
The SD file of 3D docked molecules is also available.